In einem Geschäftsprozess gibt es immer Aktivitäten, die entweder schon automatisiert sind oder automatisiert werden sollen. Bonzai stellt dazu entsprechende Extension Points zur Verfügung. Dabei ist das Verschicken von Emails der einfachste Fall. Komplexere Aktivitäten reichen vom Auslösen anderer Prozesse über das Warten auf externe Files, Nachrichten oder Trigger bis zum automatischen Aktualisieren von Daten in anderen Systemen.

Die Forderung nach Transparenz wird natürlich auch im Bereich der Automatisierung erfüllt: Jede Aktivität wird in der History gespeichert und kann sich für eine der gemäss dem Prozess gültigen Folgeaktivitäten entscheiden und so den Prozess weiter treiben.